Justin Mariner a grandi en Nouvelle-Écosse, où il étudia la guitare et le violon. Il s’intéresse à la composition à l’université Dalhousie, où il obtient un baccalauréat en musique en 1993. Il déménage à Montréal en 1993 et fait sa maîtrise en musique en 1996, à la faculté de musique de l’université McGill, sous la direction de Bruce Mather et Brian Cherney. Il obtient son doctorat en musique (2003) sous la direction de Denys Bouliane. En juin 1998, il participe à l’Académie d’été de l’IRCAM, Il enseigne la composition au Conservatoire de musique de McGill depuis 1996. En 2001, il se joint à la direction de l’Ensemble Kore.
Il a reçu des commandes d’œuvres de la Société de musique contemporaine du Québec (SMCQ), de l’Ensemble contemporain de Montréal (ECM), de Brigitte Poulain, du Quatuor Bozzini, du Trio Chanteclair, du Trio Contrastes et de l’Association des Orchestres de jeunes du Québec. Ses oeuvres ont été interprétées par le Continuum Contemporary Music et l’Orchestre métropolitain du grand Montréal. Son genre musical s’inspire notamment du répertoire varié de la musique traditionnelle, où les éléments techniques sont sublimés par un langage musical affichant un intérêt pour les modèles et l’habileté de l’auditeur à les percevoir. Ses compositions ont été retenues en finales au Concours des jeunes compositeurs de la Fondation SOCAN, à la Canadian Composers Competition de l’Orchestre symphonique de Winnipeg et à l’International Gaudeamus Music Week. Il a reçu le Prix des Jeunesses Musicales du Canada pour le Concours national des jeunes compositeurs de Radio-Canada en 1999. Il travaille actuellement avec son frère Haydon Mariner, un illustrateur de bandes dessinées. Le résultat de cette collaboration — une oeuvre comprenant des projections, de la narration et des instruments acoustiques et électroniques — sera créée par l’Ensemble Kore en avril 2005.